Учёные выяснили, в каких опухолях действительно живут микроорганизмы
Учёные провели одно из крупнейших исследований, посвящённых микробиому опухолей, и выяснили, какие виды рака действительно сопровождаются присутствием микроорганизмов. Работа помогает разобраться в многолетних противоречиях в этой области и может стать основой для дальнейших исследований, направленных на улучшение диагностики и лечения онкологических заболеваний. Подробности опубликованы в журнале MedicalXpress.
Для анализа исследователи использовали данные проекта Genomics England, включающие генетическую информацию более чем о 16 тысячах опухолей из программы «100 000 геномов». Авторы разработали новый алгоритм, который позволяет максимально точно отделять настоящие микробные сигналы от загрязнений, возникающих при лабораторной обработке образцов.
Результаты показали, что большинство изученных видов рака, включая опухоли головного мозга, молочной железы и почек, не имеют собственного микробиома, который можно было бы достоверно отличить от фонового загрязнения. По мнению исследователей, часть предыдущих работ могла ошибочно связывать эти опухоли с микроорганизмами из-за случайного попадания чужеродной ДНК в образцы.
В то же время опухоли полости рта, пищевода, желудка и кишечника содержали устойчивые признаки присутствия микроорганизмов. Учёные обнаружили в них бактерии, вирусы, грибы, археи, а в некоторых случаях — одноклеточных паразитов трихомонад. Состав микробных сообществ различался в зависимости от локализации опухоли, её подтипа и количества генетических мутаций.
Авторы также сделали разработанный алгоритм и перечень подтверждённых микроорганизмов общедоступными, чтобы другие исследовательские группы могли использовать единый подход при анализе своих данных. По мнению учёных, это позволит сосредоточить дальнейшие исследования на тех видах рака, где роль микробиома действительно подтверждается. В перспективе это может способствовать разработке новых методов ранней диагностики и лечения опухолей пищеварительного тракта.
Ранее учёные из клиники Майо выявили ранее неизвестный этап формирования противоопухолевого иммунного ответа. Как оказалось, часть иммунных клеток начинает подготовку к борьбе с раковыми клетками ещё в тимусе — органе, где происходит созревание Т-лимфоцитов.
