Ученые: успешная прививка против ВИЧ оставляет «подпись»

В августе в журнале Science Translational Medicine была опубликована статья, где были приведены данные анализа транскриптомов клеток группы приматов, принимавших участие в тестировании прививки от двух типов вируса иммунодефицита. Организм части из них ответил на возбудителя, остальные – нет. В ходе сопоставления образцов тканей учеными были обнаружены изменения в активности группы генов В-клеток, связанные с приобретением протективных свойств в отношении ВИЧ.

«Подпись», найденная авторами исследования, была также замечена и образцах ткани тех людей, которые ранее получили прививку не показавшей достаточной эффективности вакцины RV144.

Как отмечают специалисты, несмотря на высокий интерес к разработкам профилактических средств от ВИЧ-инфекции, на текущий момент достаточно эффективная вакцина против ВИЧ еще не используется. Основная причина этого – крайне высокая скорость изменчивости вируса.

Между тем в 2018 году появилась информация об успешном завершении 1 фазы клинических исследований так называемой «мозаичной» вакцины. Продукт был создан на основе аденовирусного вектора Ad26 с фрагментами трех вирусных белков, присутствующих в основных штаммах вируса. При этом в роли адъюванта — усилителя вакцины — был использован гликопротеин gp140 штамма HPV1.

Испытания на приматах (модифицированный ВИО) и людях, имеющих повышенный риск инфицирования ВИЧ, продемонстрировали хорошую безопасность и эффективность вакцины. Тем не менее, и здесь специалисты были вынуждены констатировать, что инъекция все же не обеспечивала абсолютной защиты от вируса.

Чтобы выяснить причины «неудач», исследователи из нескольких американских институтов провели анализ образцов из доклинических испытаний и сравнили транскриптомы клеток крови, ответивших на вирус и не добившихся успеха.

Классический поиск не установил отдельных генов со статистически значимым изменением активности, поэтому ученые постепенно перешли от анализа отдельных генов к проверке их групп из базы данных MSigDB.

Д-р Филип Эренберг и его коллеги заявили, что нашли кластер из 200 генов, экспрессия которых заметно отличалась у В-клеток успешно и безуспешно привитых приматов. Как отмечается, тем самым они получили «транскриптомную подпись» удачного применения вакцины.

Интересно, что описанный кластер был составлен в рамках абсолютно не связанных с данной работой исследований эффективности вакцины против гриппа.

По словам ученых, на вакцину против ВИЧ ответили 70% генов кластера (140), причем на оба типа вируса (ВИО и модифицированного ВИО) – только 26,5% (53).

Следующим этапом работы был поиск «подписи» у привитых людей.

Как отмечается в результатах исследования, ввиду малой выборки, принимавшей участие в КИ 1 фазы Ad26, микробиологами был также проанализирован достаточно большой объем данных испытаний вакцины RV144. Последняя, будучи предшественницей Ad26, была поставлена 14 тыс. жителей Таиланда и сумела сократить заболеваемость ВИЧ-инфекцией на треть.

Когда было проведено сопоставление образцов участников, инфицированных после вакцинации и получивших достаточную противовирусную защиту, в материалах последних также была обнаружена «подпись».

53 ключевых гена, речь о которых шла раньше, имели тесные связи и формировали 5 функциональных групп. Каждый из них оказался в разной степени связан с успехом вакцины, и ученым удалось выделить несколько наиболее эффективных из них.

Тем не менее, добавили авторы работы, из-за малого числа участников подтверждения существования транскриптомной «подписи» у людей, успешно привитых вакциной Ad26, пока обнаружено не было.