Разработан цифровой тест для определения вирусной нагрузки ВИЧ

Специалисты из США разработали быстрый и экономически выгодный цифровой тест, который позволяет напрямую измерить вирусную нагрузку ВИЧ по одной капле крови. По мнению разработчиков, этот анализ в перспективе может использоваться для диагностики нескольких инфекционных заболеваний. Статья опубликована в журнале ACS Nano.

Обычные тесты на вирусную нагрузку включают в себя взятие генетического материала, его амплификацию (создание дополнительных копий участков ДНК) и сравнение с эталонными образцами.

Команда экспертов из Инженерного колледжа Пенсильвании применила более прямой подход к своему тесту под названием STAMP («Самооцифровка посредством автоматизированного разделения на основе мембран»). По словам разработчиков, это устройство дешевле, быстрее и требует меньше крови, чем стандартный тест ОТ-ПЦР.

Как работает тест-система STAMP:

• берётся небольшой образец крови человека;
• из него извлекается вирусная РНК и смешивается со специальным белком Cas13, который является частью системы CRISPR (в данном случае CRISPR-Cas13 работает для обнаружения ВИЧ);
• затем в эту смесь помещается  нанопористая поликарбонатная мембрана (тонкий фильтр);
• нанопоры делят смесь на отдельные капли, содержащие только одну молекулу РНК, к которой присоединился белок Cas13;
• если в молекуле РНК есть ВИЧ, белок Cas13 генерирует сигнал о наличии вируса;
• подсчитав количество «сигнальных» капель, можно определить количество вируса в крови.

Новый метод был протестирован на образцах плазмы 20 пациентов. Точность измерения вирусной нагрузки была практически такой же, как у традиционного метода ОТ-ПЦР. Но для теста STAMP требуется меньше крови. Также команда обнаружила, что этот подход может обеспечить точную оценку вирусной нагрузки на уровне около 2000 копий.

Ранее в США был представлен новый молекулярный тест QUAL РНК ВИЧ, который используется для диагностики и подтверждения ВИЧ-инфекции по крови пациента.