Связь между кишечной микробиотой и размером латентного резервуара ВИЧ: новое исследование
Исследователи из Каролинского института (Karolinska Institutet) изучили связь между кишечной микробиотой и размером скрытого резервуара ВИЧ. Цель учёных состояла в том, чтобы выяснить, может ли состав кишечных бактерий влиять на количество вируса, который сохраняется в организме людей, получающих антиретровирусную терапию (АРТ). Результаты работы опубликованы в журнале Gut Pathogens.
Даже при эффективном лечении ВИЧ не исчезает полностью. Инфекция сохраняется в латентной форме, формируя в клетках вирусные резервуары. Их наличие не позволяет окончательно избавить организм от вируса. Исследователи предположили, что кишечный микробиом может быть связан с размером этого резервуара.
В исследовании приняли участие 30 человек с ВИЧ, которые длительное время принимали АРТ. Для анализа образцов крови учёные использовали метод IPDA, измеряющий количество интактной провирусной ДНК (то есть полноценного вирусного генетического материала). Состав кишечной микробиоты оценивали с помощью метагеномного секвенирования (shotgun sequencing), позволяющего анализировать полный генетический материал образца и определять состав бактерий и их функции.
Учёные выяснили, что у пациентов с небольшим вирусным резервуаром распределение бактерий в кишечнике менее равномерно. Также были выявлены виды бактерий, которые чаще встречались у таких людей: Faecalibacterium prausnitzii, Lachnospira sp000437735 и Phocaeicola plebeius. В то же время такая бактерия как Prevotella copri, связанная с воспалительными процессами, чаще обнаруживалась у людей с более крупным резервуаром ВИЧ.
Кроме состава микробиоты, различались и метаболические процессы (химические реакции в организме). У людей с более высоким уровнем латентного вируса были активнее процессы гликолиза (расщепления сахаров) и синтеза аминокислот с разветвлённой цепью (важных компонентов белков).
Вывод
Результаты исследования показали, что размер вирусного резервуара может быть связан с составом кишечного микробиома, его разнообразием и метаболической активностью. Однако для окончательных выводов требуются более крупные и длительные исследования, заявляют эксперты.
Ранее опубликованное исследование показало, что у участников, получавших терапию с долутегравиром, был более разнообразный и сбалансированный микробиом кишечника. Учёные также отмечают снижение воспаления и иммунной активации.
