Диагностика возможных оппортунистических инфекций: тестирование нового метода
Оппортунистические инфекции являются одной из основных причин смертности среди людей, живущих с ВИЧ. Поэтому быстрая и ранняя диагностика возбудителей необходима для оптимизации лечения и улучшения прогноза для пациента. Поскольку обычные методы обнаружения патогенов имеют множество ограничений, эксперты решили обратиться к технологии метагеномного секвенирования нового поколения (mNGS). Результаты соответствующего исследование опубликованы в журнале Dovepress.
В последнее десятилетие технология mNGS быстро развивалась и активно применялась в клинических исследованиях. А в последние годы распространилась на область инфекционных заболеваний благодаря своей способности быстро идентифицировать патогены. Она обеспечивает высокую производительность, быструю обработку результатов и высокую точность в обнаружении микробов. Но из-за высокой стоимости применение данной технологии среди людей, живущих с ВИЧ, в настоящее время сильно ограничено.
Цель данного исследования — оценить потенциал mNGS в качестве метода диагностики первой линии у пациентов с ВИЧ по сравнению с обычными комплексными микробиологическими тестами.
Исследование
Пациенты из больницы в Ханчжоу (Китай), принимавшие участие в исследовании, предоставили 49 образцов (кровь, спинномозговая жидкость, костный мозг, мокрота, плевральная жидкость и т.д.). Все образцы были отправлены на mNGS.
Эксперты установили, что у технологии метагеномного секвенирования была лучшая частота обнаружения грибков и нетуберкулёзных бактерий, чем у микробиологических тестов. Не было различий в частоте обнаружения других возбудителей (бактерии, микобактерии туберкулёза, вирусы).
Чувствительность mNGS по отношению к микробиологическим тестам:
- Грибки: 91% против 74%
- Бактерии: 50% против 98%
- Микобактерии туберкулёза: 0% против 86%
- Нетуберкулёзные микобактерии: 100% против 87%
- Вирусы: 100% против 91%
Учёные считают, что технология mNGS представляет собой альтернативный и многообещающий метод выявления подозрений на оппортунистические инфекции у людей, живущих с ВИЧ. Наиболее эффективной стратегией может быть использование обоих методов диагностики.
Ранее Всемирная организация здравоохранения одобрила новые кожные тесты для выявления туберкулёза. TBST-тесты могут заменить туберкулиновую кожную пробу и анализ высвобождения гамма-интерферона IGRA.